詳細劇情
在不遠的未來，海平面原因不明地急速上升，導致了地表多數都沉入海中。
小時候因爲事故而失去一條腿的少年・斑鳩夏生，厭倦了都市的生活，移居到了海邊的鄉村小鎮。曾經身爲海洋地質學家的祖母留給他的、就只有船、潛水艇還有債務。
夏生爲了取回「失去的未來」，與迷之討債人凱薩琳一起，潛海前往據說保存著祖母遺產的海底倉庫。
在那裡，他遇到了一位沉睡在如同棺材一般裝置中不可思議的少女「亞托莉」。她是一位構造精密到與人類別無二致，而又豐富感情的機器人。
從海底被打撈起來的亞托莉如是說到：
「我想完成主人留給我的最後的命令。在此之前，我會成爲夏生先生的腿！」
在一個逐漸沉入海中的平和小鎮，少年和機器人少女的難忘夏日就這麼開始了。
