天海護乘坐加里安在宇宙中搜索殘存的佐達，但是有了意外的發現——用收集宇宙中的暗黑物質來再生三重連太陽系的parts Q Machine和執行這一行動的索魯11遊星主。在索魯11遊星主否決了宇宙和三重連太陽系共存的可能性後，護下了決心。護利用複製人和複製的加離安吸引住11遊星主的主意，然後奪走parts Q machine，並把真正的加里安藏在11遊星主不敢接近的G水晶里，不過複製人卻被遊星主俘獲。
J-Ark在木星決戰後被the power拋到宇宙的邊緣，發現了一些不對勁的可疑跡象。調查過程中，竟然遇到了被索魯十一遊星主追擊的真正的小護。小護將parts Q Machine交給戒道，告訴他不能讓它落入索魯11遊星主的手中。J發射ES火箭讓他們逃走，自己留下應敵，不敵被俘。從ES Window中脫出的戒道墜入地球，parts Q Machine則分裂成幾個部分。
地球上，小護離開1年後，初野華在遛狗（大狗狗已經有了7個兒女，名字是星期一到星期日……）途中，意外的發現自己的心上人——天海護回到了地球。可是，他卻在與戒道打鬥！
在法國巴黎市內，特殊犯罪調查官露娜•加迪夫•獅子王率領新型AI光龍、暗龍對奪取Q PARTS的犯罪組織Bio Net展開追捕。對方是外表像個機械骷髏的基姆萊特（Gimlet），它雖然沒有佐達、原種那樣的融合能力，但是也是個頗令人頭疼的傢伙。好在，3G也盯上了Bio Net，已經恢復肉身、成爲超進化人的獅子王凱也來到巴黎。雖然加里安被小護帶走，但是3G製造了可以藍色戰機Fantom Gao（fantom同phantom，意爲「幻影」），凱與Fantom Gao融合成外形極爲類似GaiGar的GaoFar，與基姆萊特展開搏鬥。但是沒想到這個傢伙能與一些組件組合成不同樣式，很是難纏，於是凱喚來Liner-Gao II、Drill-Gao II、Stealth-Gao III進行最終融合（不過審批手續比原來繁雜了，3G的新頭頭是個磨磨蹭蹭的面瓜老頭）。基姆萊特得機器人終於在新生勇者王GaoFighGar的黃金之錘下變成了光，而基姆萊特也被露娜打爆。
不情願變成改造人、終生都要披著了冷卻外套的露娜是獅子王雷牙博士的女兒，在她冷酷的外表下，其實有著一顆受過傷害的脆弱心靈。
但是，不是只有Bio Net對Q Parts感興趣，存放在世界各地的Q Parts的各個部件接連被盜，而罪犯竟然是小護！ 「對不起……」小護的表情雖然令人憐愛，但是他所做的事卻不能讓人原諒，他造成了猿頭寺耕助的心上人——有超感應能力的帕彼亞的死亡。憤怒的凱用GaoFighGai對一意孤行的小護宣戰，而小護則使用GaoGaiGar應戰。但出人意料的是，那個加里安竟然是全白的，莫非……
連黃金之錘也不敵小護的「天與地」，凱只好在雨中與小護展開「天與地」的對決。 ...