在櫻花爛漫的季節里,無憂無慮的草帽海賊團盡情享受快樂時光。途中喬巴救上了一個魁梧健碩的傢伙,最引人注目的是他的右腕裝配了用海樓石做成的機械手腕,凡是觸碰過手腕的人均能力盡失。原來此人便是曾經培養出無數優秀弟子的原海軍大將Z(大冢芳忠 配音)。甦醒後的Z得知路飛(田中真弓 配音)等人的身份後反目成仇,與隨後趕來的下屬艾伊(筱原涼子 配音)和賓茲(香川照之 配音)對草帽海賊團予以殘酷無情的重創。原來Z因某件往事而對海賊極度憎恨,此時他正醞釀一項恐怖計劃,勢要帶領「NEO海軍」將新世界的海賊一舉殲滅。他的行動引起海軍本部的忌憚,而慘敗的路飛等人也將向這個前所未有的敵人展開新的挑戰……
本片爲同名漫畫改編的劇場版動畫,原著作者尾田榮一郎擔任製作總指揮,艾薇兒演唱主題歌《How You Remind Me》和《Bad Reputation》。